Elle a été fermée le 15 juin 2001 sur ordre du Commandant de la Base aérienne, faute de personnel compétent pour la gérer, suite au départ des personnels qui la faisaient fonctionner auparavant.
Elle utilisa, de 1957 à 1967, deux modèles de timbres à date hexagonaux (angles fermés ou ouverts) avec mention « COLMAR-AIR HAUT-RHIN ». Elle mit ensuite en service des timbres à date circulaires (en métal puis en plastique) comportant la mention « 68-COLMAR-AIR HAUT-RHIN ».

L’agence fut dotée, à la fin des années 1980, d’une oblitération mécanique SECAP à lignes ondulées.

Elle était également dotée de diverses griffes linéaires et marques accessoires.