La Compagnie de Quartier Général du Secteur de Sarajevo (HQ COY – Headquarter company) était composée d’environ 250 hommes, aux ordres d’un capitaine. Elle se composait de :

 une unité de commandement (cellule services administratifs, cellule services techniques, vaguemestre, cellule carburant,
 cellule casernement, cellule ordinaire, cellule atelier auto),
 une section de transmissions,
 un peloton d’état-major,
 une section médicale (le Groupe Médico-Chirurgical ou GMC),
 deux sections de protection.

Rattachée administrativement au Bataillon d’infanterie n° 2, la compagnie vivait en fait de manière autonome aux ordres directs de l’Etat-Major du Secteur. Ses missions étaient d’assurer le soutien de l’Etat-Major international du Secteur de Sarajevo, la protection et le filtrage du « PTT Building » (siège du Commandement du Secteur de Sarajevo, situé à l’ouest de la ville sur « Sniper Avenue ») ainsi que des missions de protection du génie et d’escortes de convois UNHCR, de délégations serbes, bosniaques ou croates.

Elle était desservie par le bureau postal militaire 655 de Sarajevo.