Répartis sur l’ensemble du théâtre des Balkans (Albanie, Bosnie-Herzégovine, Croatie, Kosovo, Monténégro, Macédoine), les 300 membres (assistés de 190 employés locaux) de la mission agissent comme des tiers impartiaux et neutres. Les observateurs sont entièrement habillés de blanc et ne sont pas armés.
Le Quartier général de la mission se trouvait jusqu’en 1998 à Zagreb ; il se trouve depuis à Sarajevo. Une dizaine de centres régionaux sont répartis sur l’ensemble du théâtre.

Les membres de la mission sont issus des 15 pays de l’Union européenne ainsi que de quelques pays de l’OSCE.

La participation française est, depuis le début, la plus importante par le nombre de personnes affectées et par sa contribution financière.

Dans les premières années, le courrier de la mission et de ses membres était acheminé via la poste militaire des différents contingents. Suite au rétablissement de la pays dans les Balkans, une partie du courrier est désormais acheminé via la poste civile des pays hôtes.